Stephan Eisel ist ordentliches Mitglied im Ausschuss für die Angelegenheiten der Europäischen Union, dem Europaausschuss des Deutschen Bundestages.
Dort hat er als Berichterstatter die Federführung der CDU/CSU-Bundestagsfraktion das Themenfeld "Aussenbeziehungen der Europäischen Union". Dazu gehören u. a. die Gemeinsame Aussen- und Sicherheitspolitik (GASP, die Europäische Sicherheits- und Verteidigungspolitik (EVSP) und die Entwicklungszusammenarbeit. Ausserdem ist Stephan Eisel Berichterstatter für Polen und das Vereinigte Königreich.
Aus diesen Fakten ergibt sich eine neue, zusätzliche Legitimation der europäischen Einigung. In den letzten Jahrzehnten hat sie sich vor allem als erfolgreiches Modell der Friedens- und Freiheitssicherung auf unserem Kontinent bewährt. Dies bleibt notwendig und richtig und der Auftrag nach innen. Aber Europa gewinnt neue Legitimität, weil es seine Grundwerte nicht nur nach innen sichern, sondern auch außerhalb verteidigen muss. Nur so hat Europa auch die Chance, die eigene freiheitliche politische Kultur für sich selbst zu bewahren und Einfluss auf die Entwicklung der Weltgemeinschaft zu nehmen.